不同类型实验室，其空调通风系统有不同的要求。在进行疾控中心实验室设计时，根据不同实验室的实验室压力梯度、洁净度与温湿度要求，结合生物安全等实验室专业要求，实验室设计公司将实验室大致分成五种类型。

第1类型 既要保证一定压力梯度又要保证相应洁净度要求的负压实验室。此类实验室主要包括BSL-3和BSL-4实验室，也包括一些负压状态下的BSL-2实验室。对BSL-3和BSL-4实验室的建设要求，GB50346-2004《生物安全实验室建筑技术规范》做了严格的规定。

第2类型 有洁净度要求且具有相对压力梯度的正压实验室。此类实验室主要为单纯性洁净实验室，包括SPF动物实验室、部分卫生微生物实验室、ICP-MS分析仪器实验室等。

第3类型 要保证一定压力梯度但对室内无洁净度要求的负压实验室。对于一些具有较高风险的BSL-2实验室，可按负压进行设计。如流感实验室、结核杆菌耐药实验室等。通常，在实验室建设中，负压与洁净是相伴设置的，但是，当受条件限制时，根据具体情况也可省去洁净条件，仅按负压条件设置。

第4类型 对温湿度有较高要求的恒温恒湿实验室。此类实验室主包括环境空气仓、空气消毒实验室、昆虫饲养室、杀虫模拟现场等实验室。

第5类型 对压力梯度、洁净度及温湿度都无具体要求的普通实验室。此类实验室包括大部分理化实验室（如：化学分析室、样品处理室、气相色谱室、气/液质联用仪、原子吸收室等实验室）、BSL-1实验室（包括分子细菌学实验室、免疫学实验室、肝炎实验室、厌氧实验室等）。